Учёные нашли белок, делающий коронавирус невидимым для имунной системы

В США молекулярные биологи обнаружили белковый механизм, который делает РНК коронавируса COVID-19 невидимой для врождённой иммунной системы тех клеток, в которые он уже успел проникнуть. Об этом сообщил научный журнал Nature Communications в пятницу, 24 июля.



«Вирус вырабатывает белок nsp16, который особым образом меняет структуру концевых участков копий его генома. Эти изменения играют роль камуфляжа, который обманывает клетку и заставляет её считать вирусную РНК частью самой себя, а не чужеродным включением, — объяснил один из авторов исследования, доцент Университета штата Техас в Сан-Антонио Йогеш Гупта.



Учёные считают, что после заражения COVID-19 в работе иммунитета развиваются тяжёлые нарушения.



Кроме того, возникают и другие проблемы — массовые воспаления, микротромбы, которые и без коронавируса угрожают жизни пациента. Сейчас учёные пытаются понять, почему они появляются и как их предотвратить.



Для ответа на этот вопрос, как отмечает Гупта, важно понимать, как коронавирус проникает в клетки человека, обходит встроенную систему защиты и как его появление меняет жизнедеятельность этих клеток.



Первая фаза этого процесса — «перевод генома вируса на «язык, понятный для клетки.



Для этого в каждой частице коронавируса есть набор вспомогательных белков, которые особым образом изменяют концевые участки его РНК-молекулы, добавляя к ним короткий сегмент. Биологи называют его «кэпом.



Эта структура состоит из молекулы 7-метилгуанозина — аналога одной из «букв РНК и ДНК, она есть на всех РНК-копиях генов многоклеточных организмов.



«Кэп служит меткой, по которой клетки распознают свой и чужой генетический материал. Если его нет, «чужака уничтожают.



Вирусы пытаются противодействовать этому, используя свои собственные метки или воруя их у клетки.



Гупта и его коллеги выяснили, что в случае коронавируса эту задачу решает белок nsp16. Учёные выяснили его точную трехмерную структуру, а также исследовали свойства фермента nsp10, который играет важную роль в формировании «кэпа на копиях генома SARS-CoV-2.



Для этого учёные получили большое количество их молекул, соединили их с 7-метилгуанозином, после чего заморозили и просветили их с помощью рентгеновского кристаллографа.



Благодаря этому Гупта с коллегами поняли, как именно этот белок делает молекулы РНК коронавируса невидимыми для иммунитета. В частности они выделили несколько критически важных участков nsp16 и nsp10, дестабилизация которых может вывести эту систему вирусного камуфляжа из строя.



Интересно то, что у SARS-CoV-2, возбудителей атипичной пневмонии, обычной простуды и коронавирусов животных структура nsp16 значительно отличается. Как именно различия в их структуре влияют на работу фермента, учёные пока не могут точно сказать.



Однако их расчёты показывают, что они могут повышать его активность и расширять возможный «репертуар молекул, с которым nsp16 может взаимодействовать.



Дальнейшее изучение уязвимых мест nsp16 и nsp10, как надеется Гупта, приведёт к созданию коротких молекул, которые смогут заблокировать их действие и сделать вирус видимым для врождённой иммунной системы человека и других потенциальных жертв COVID-19.